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常见问题解答:肽微阵列

请参考下面相应的常见问题解答。
如果找不到您要查找的问题,请联系我们的客户支持团队:peptide@jpt.com

我需要什么样的硬件来读出我的肽微阵列?

您需要具有以下规格的微阵列扫描仪:
对于低密度肽微阵列(最多3 x 384肽/微阵列):
-最小扫描分辨率:50 um /像素-应该可以聚焦-强度应该可调
-幻灯片大小:1 x 3英寸
-扫描区域的大小至少应为63 x 21mm
-消光/发射滤光片,取决于所使用的荧光团
对于高密度肽微阵列(超过3 x 384肽/微阵列):
-最低扫描分辨率:10 um /像素
-应该可以聚焦-强度应该可以调节-滑动片的尺寸:1 x 3英寸
-扫描区域的大小至少应为63 x 21mm
-消光/发射滤光片,取决于所使用的荧光团
-能够读取和分析.gal文件的软件。
JPT正在使用Genepix Axon 4000B,Genepix 4200和Genepix 4300 Scanner系统。生成的图像应为8位或16位格式,以便与大多数微阵列处理软件兼容。

您对肽微阵列有特定的协议吗?

JPT肽技术公司与每种肽微阵列一起提供详细的方案。
这些也可以是已下载 从我们的网站。

JPT QC如何生产肽微阵列?

对于每个合成批次,我们都会运行精选的对照肽,并通过HPLC-MS分析,并且需要通过质量控制。
这些对照肽包括难以合成的序列。
印刷后,使用我们的高通量扫描设备扫描每个微阵列载玻片,并检查固定的肽阵列的完整性和均匀性。

肽如何固定在微阵列上?

肽经由N端化学选择性地共价连接至微阵列表面。
将柔性接头插入肽和微阵列表面之间,以确保肽内结合位点的可用性。
通过在合成过程中加盖步骤,我们实现了仅全长肽带有N末端偶联部分,因此能够在固定过程中高通量纯化所有肽。

您是否建议用丝氨酸残基取代半胱氨酸残基?

是的,因为含半胱氨酸的肽对氧化和环化非常敏感,所以用Ser取代Cys可增加肽的稳定性。
另外,半胱氨酸残基和抗体/蛋白质之间有时会发生非特异性相互作用,并产生假阳性结果。
最后,半胱氨酸几乎不是抗体表位中的必需残基。

孵化结果如何评估?

黄曼凝 JPT建议结合使用荧光读数系统和染料标记的抗体。
由于玻璃表面针对荧光扫描仪系统中的低背景进行了优化,因此可以使用高分辨率激光扫描仪实现高信噪比。

微阵列上每种肽的浓度是多少?

固定在一个点(直径100μm)上的肽的量取决于肽微阵列的表面负载。
实验表明负载量为4 pmol/mm3。
因此,固定在一个斑点上的肽量约为30 fmol /肽。

肽微阵列的大小是多少?

JPT′s peptide microarrays are compatible with most scanner system accepting microarrays of 1 x 3 inches (or 2.5 x 7.5 cm).

肽微阵列上肽点的大小是多少?

每个斑点的直径约为80-140μm。
大小主要取决于斑点肽溶液的物理化学性质,很难预测。

What is the layout of JPT′s microarrays?

我们所有的微阵列均以数个拷贝展示每种肽,以确保可验证的结果。
产品说明中注明了每个微阵列的确切布局。

What is the chemical stability of JPT′s peptide microarrays?

肽与微阵列表面之间的键在pH 4 -10范围内稳定。
较高或较低的pH值可能会由于降解而导致信号丢失。

微阵列的合适储存条件是什么?

肽微阵列应保存在4°C下。
JPT建议不要冷冻微阵列,因为冻融循环对玻璃表面的影响尚不清楚。
正确存储后,我们的肽微阵列可以稳定保存18个月。

是否可以再生肽微阵列?

JPT不建议通过从表面剥离结合的蛋白质或抗体来再生肽微阵列,因为这样会损坏表面,而且蛋白质或抗体的残留量极低也会引起很高的背景。

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